Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt9Q6RHW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt9Q6RHW0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms