Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrm2bQ6PEE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms