Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbtb39Q6PDK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbtb39Q6PDK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms