Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc4Q6PAV2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herc4Q6PAV2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herc4Q6PAV2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms