Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcrQ6PAJ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcrQ6PAJ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms