Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp49Q6P9L4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp49Q6P9L4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp49Q6P9L4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms