Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BC061212Q6P8K3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BC061212Q6P8K3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms