Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Frmd5Q6P5H6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Frmd5Q6P5H6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Frmd5Q6P5H6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Frmd5Q6P5H6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Frmd5Q6P5H6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmd5Q6P5H6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Frmd5Q6P5H6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frmd5Q6P5H6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Frmd5Q6P5H6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Frmd5Q6P5H6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frmd5Q6P5H6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.9 ms