Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig3Q6P1C6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig3Q6P1C6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig3Q6P1C6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms