Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf9bQ6NZA9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf9bQ6NZA9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms