Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc66Q6NS45 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms