Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Jmjd1cQ69ZK6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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