Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Msl2Q69ZF8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msl2Q69ZF8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msl2Q69ZF8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms