Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprjQ64455 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprjQ64455 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PtprjQ64455 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PtprjQ64455 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PtprjQ64455 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprjQ64455 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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PtprjQ64455 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PtprjQ64455 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PtprjQ64455 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PtprjQ64455 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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PtprjQ64455 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprjQ64455 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprjQ64455 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms