Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lcn4Q62472 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lcn4Q62472 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lcn4Q62472 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lcn4Q62472 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn4Q62472 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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