Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp1Q62442 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp1Q62442 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms