Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema4bQ62179 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema4bQ62179 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms