Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbpQ61805 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LbpQ61805 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LbpQ61805 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LbpQ61805 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LbpQ61805 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LbpQ61805 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LbpQ61805 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms