Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccna1Q61456 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccna1Q61456 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccna1Q61456 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms