Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde3bQ61409 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde3bQ61409 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde3bQ61409 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms