Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf3Q60980 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf3Q60980 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms