Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbc1d1Q60949 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d1Q60949 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d1Q60949 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms