Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms