Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a4Q5XF90 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a4Q5XF90 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.3 ms