Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r195Q5SVD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms