Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r223Q5SSA0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms