Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna2d4Q5RJF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d4Q5RJF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms