Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv4Q5R1A3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv4Q5R1A3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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