Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttf2Q5NC05 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms