Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kctd1Q5M956 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kctd1Q5M956 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kctd1Q5M956 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms