Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chsy3Q5DTK1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chsy3Q5DTK1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms