Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syne3Q4FZC9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syne3Q4FZC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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