Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Krtap1-4Q3V2D6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap1-4Q3V2D6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms