Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ulk4Q3V129 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ulk4Q3V129 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ulk4Q3V129 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.1 ms