Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc110Q3V125 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc110Q3V125 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms