Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls1Q3V0K9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pls1Q3V0K9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls1Q3V0K9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms