Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk4Q3V016 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk4Q3V016 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms