Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim75Q3UWZ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim75Q3UWZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim75Q3UWZ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim75Q3UWZ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim75Q3UWZ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim75Q3UWZ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms