Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm29609Q3UU56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm29609Q3UU56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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