Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thsd4Q3UTY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Thsd4Q3UTY6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thsd4Q3UTY6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms