Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy4Q3UQI9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy4Q3UQI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms