Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms