Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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D13Ertd608eQ3UPR8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms