Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap2Q3UND0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skap2Q3UND0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms