Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl2Q3UMU9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdgfl2Q3UMU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms