Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog7Q3UM29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog7Q3UM29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms