Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc61Q3UJV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc61Q3UJV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms