Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pid1Q3UBG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pid1Q3UBG2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms