Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms