Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim6Q3U0I6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim6Q3U0I6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms